<pre style='margin:0'>
Eric A. Borisch (eborisch) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/86f87e9d7727ee70b7e35a91d940104640580740">https://github.com/macports/macports-ports/commit/86f87e9d7727ee70b7e35a91d940104640580740</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8">The following commit(s) were added to refs/heads/master by this push:
<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>     new 86f87e9  hdf5: Take ownership; update to 1.10.6; bump deps. (#6099)
</span>86f87e9 is described below

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit 86f87e9d7727ee70b7e35a91d940104640580740
</span>Author: Eric A. Borisch <eborisch@macports.org>
AuthorDate: Mon Jan 6 09:37:25 2020 -0600

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    hdf5: Take ownership; update to 1.10.6; bump deps. (#6099)
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * hdf5: Update to 1.10.6; take (open)maintainership
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * Rev-bump ports depending on HDF5
</span>---
 gis/gdal/Portfile                                    |  2 +-
 gis/kealib/Portfile                                  |  2 +-
 graphics/InsightToolkit-devel/Portfile               |  2 +-
 graphics/field3d/Portfile                            |  2 +-
 graphics/vigra/Portfile                              |  2 +-
 graphics/vips/Portfile                               |  2 +-
 graphics/vtk/Portfile                                |  2 +-
 math/caffe/Portfile                                  |  2 +-
 math/deal.ii/Portfile                                |  2 +-
 math/dolfin/Portfile                                 |  2 +-
 math/gnudatalanguage/Portfile                        |  2 +-
 math/mathgl/Portfile                                 |  2 +-
 math/octave/Portfile                                 |  2 +-
 math/petsc/Portfile                                  |  2 +-
 math/shogun-devel/Portfile                           |  2 +-
 math/shogun/Portfile                                 |  4 ++--
 perl/p5-pdl-io-hdf5/Portfile                         |  2 +-
 python/py-h5py/Portfile                              |  2 +-
 python/py-isce2/Portfile                             |  2 +-
 python/py-nio/Portfile                               |  2 +-
 python/py-pyne/Portfile                              |  2 +-
 python/py-stfio/Portfile                             |  2 +-
 python/py-tables/Portfile                            |  4 ++--
 science/ALPSCore/Portfile                            |  2 +-
 science/ALPSMaxent/Portfile                          |  2 +-
 science/H5Part/Portfile                              |  2 +-
 science/HDF5-External-Filter-Plugins/Portfile        |  2 +-
 science/alps/Portfile                                |  2 +-
 science/armadillo/Portfile                           |  2 +-
 science/berkeleygw/Portfile                          |  2 +-
 science/cdo/Portfile                                 |  2 +-
 science/crystfel/Portfile                            |  2 +-
 science/digital_rf/Portfile                          |  2 +-
 science/flann/Portfile                               |  2 +-
 science/gds/Portfile                                 |  2 +-
 science/gmsh/Portfile                                |  2 +-
 science/gmtk/Portfile                                |  2 +-
 science/gmtsar/Portfile                              |  2 +-
 science/grads/Portfile                               |  2 +-
 science/h4h5tools/Portfile                           |  2 +-
 science/h5utils/Portfile                             |  2 +-
 science/hdf5-lz4-plugin/Portfile                     |  2 +-
 science/hdf5/Portfile                                | 15 ++++++++-------
 science/hdf5/files/patch-tools-src-misc-h5cc.in.diff |  4 ++--
 science/hdfeos5/Portfile                             |  2 +-
 science/ismrmrd/Portfile                             |  2 +-
 science/lal/Portfile                                 |  6 +++---
 science/magicspp/Portfile                            |  2 +-
 science/ncarg/Portfile                               |  2 +-
 science/nco/Portfile                                 |  2 +-
 science/netcdf/Portfile                              |  2 +-
 science/paraview/Portfile                            |  2 +-
 science/silo/Portfile                                |  2 +-
 science/splash/Portfile                              |  2 +-
 science/stimfit/Portfile                             |  2 +-
 science/swarm/Portfile                               |  2 +-
 science/vapor/Portfile                               |  2 +-
 science/wgrib2/Portfile                              |  2 +-
 science/xdmf/Portfile                                |  2 +-
 59 files changed, 71 insertions(+), 70 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/gis/gdal/Portfile b/gis/gdal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 85083e9..cfe8189 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/gis/gdal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/gis/gdal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -11,7 +11,7 @@ PortGroup           conflicts_build 1.0
</span> mpi.setup
 
 github.setup        OSGeo gdal 3.0.2 v
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            1
</span> categories          gis
 license             MIT BSD
 platforms           darwin
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/gis/kealib/Portfile b/gis/kealib/Portfile
</span>old mode 100755
new mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index d3154bf..0ff9e47
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/gis/kealib/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/gis/kealib/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -4,7 +4,7 @@ PortGroup           bitbucket 1.0
</span> PortGroup           cxx11 1.1
 
 bitbucket.setup     chchrsc kealib 1.4.10
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> categories          gis
 license             MIT
 maintainers         {vince @Veence}
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/graphics/InsightToolkit-devel/Portfile b/graphics/InsightToolkit-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 8ea36e2..d4f1aa6 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/graphics/InsightToolkit-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/graphics/InsightToolkit-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           cmake 1.0
</span> 
 name                InsightToolkit-devel
 version             4.8.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            5
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            6
</span> categories          graphics devel
 platforms           darwin
 license             Apache
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/graphics/field3d/Portfile b/graphics/field3d/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 7c49379..ef4d668 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/graphics/field3d/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/graphics/field3d/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup               github 1.0
</span> 
 github.setup            imageworks Field3D 1.7.2 v
 name                    field3d
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                8
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                9
</span> categories              graphics
 maintainers             nomaintainer
 license                 BSD
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/graphics/vigra/Portfile b/graphics/vigra/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index cd3511f..7b4e490 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/graphics/vigra/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/graphics/vigra/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -10,7 +10,7 @@ PortGroup           cxx11 1.1
</span> 
 github.setup        ukoethe vigra 1-11-1 Version-
 version             [strsed ${github.version} {g/-/./}]
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            8
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            9
</span> categories          graphics
 platforms           darwin
 license             MIT
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/graphics/vips/Portfile b/graphics/vips/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 57f820f..dcc767a 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/graphics/vips/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/graphics/vips/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           github 1.0
</span> PortGroup           gobject_introspection 1.0
 
 github.setup        libvips libvips 8.8.4 v
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            1
</span> name                vips
 distname            vips-${version}
 description         VIPS is an image processing library.
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/graphics/vtk/Portfile b/graphics/vtk/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index bfd490e..8dc4bc1 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/graphics/vtk/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/graphics/vtk/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -8,7 +8,7 @@ PortGroup           cxx11 1.1
</span> 
 name                vtk
 version             8.1.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span> categories          graphics devel
 platforms           darwin
 license             BSD
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/caffe/Portfile b/math/caffe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index f48b160..be7cb9d 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/caffe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/caffe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           github 1.0
</span> 
 github.setup        BVLC caffe 1de4cebfb81d50267d0d8c2595372b14e1408248
 version             20170817
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            11
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            12
</span> categories          math science
 maintainers         nomaintainer
 
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/deal.ii/Portfile b/math/deal.ii/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 7167965..f3bd908 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/deal.ii/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/deal.ii/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -8,7 +8,7 @@ PortGroup               linear_algebra 1.0
</span> 
 github.setup            dealii dealii 9.1.1 v
 name                    deal.ii
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                3
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                4
</span> categories              math science
 license                 LGPL-2.1+
 maintainers             {mcalhoun @MarcusCalhoun-Lopez} openmaintainer
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/dolfin/Portfile b/math/dolfin/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index bf8df25..e2d43a6 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/dolfin/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/dolfin/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           cmake 1.1
</span> PortGroup           mpi 1.0
 
 bitbucket.setup     fenics-project dolfin 2018.1.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span> categories          math
 license             LGPL-3+
 platforms           darwin
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/gnudatalanguage/Portfile b/math/gnudatalanguage/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 81fb107..05d4e2c 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/gnudatalanguage/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/gnudatalanguage/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -8,7 +8,7 @@ PortGroup                   github 1.0
</span> PortGroup                   cxx11 1.1
 
 github.setup                gnudatalanguage gdl 0.9.9 v
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                    2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                    3
</span> name                        ${github.author}
 epoch                       2
 
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/mathgl/Portfile b/math/mathgl/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 26479ae..9681897 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/mathgl/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/mathgl/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           cmake 1.0
</span> 
 name                mathgl
 version             2.4.4
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            1
</span> categories          math
 license             GPL-3
 maintainers         {mps @Schamschula} openmaintainer
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/octave/Portfile b/math/octave/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index d356f7d..4ed2dd3 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/octave/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/octave/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -11,7 +11,7 @@ PortGroup           cxx11 1.1
</span> name                octave
 version             5.1.0
 set package_version 5.x.x
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span> categories          math science
 platforms           darwin
 license             GPL-3+
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/petsc/Portfile b/math/petsc/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 7a92963..a711b76 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/petsc/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/petsc/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -127,7 +127,7 @@ subport petsc-devel {
</span>     name                petsc-devel
     replaced_by         petsc
     version             3.7.99
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    revision            8
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    revision            9
</span> }
 
 notes               "Add the following line to your .bash_profile if you plan to use\
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/shogun-devel/Portfile b/math/shogun-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 4e3256b..f7ab4ac 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/shogun-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/shogun-devel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           cmake 1.0
</span> name                shogun-devel
 version             4.0.0
 set branch          [join [lrange [split ${version} .] 0 1] .]
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            13
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            14
</span> categories          math science
 platforms           darwin
 license             GPL-3
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/math/shogun/Portfile b/math/shogun/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 088c690..6d31970 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/math/shogun/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/math/shogun/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,9 +5,9 @@ PortGroup           compilers 1.0
</span> 
 name                shogun
 version             2.1.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> set branch          [join [lrange [split ${version} .] 0 1] .]
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</span> categories          math science
 platforms           darwin
 license             GPL-3
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/perl/p5-pdl-io-hdf5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/perl/p5-pdl-io-hdf5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           perl5 1.0
</span> 
 perl5.branches      5.26 5.28 5.30
 perl5.setup         PDL-IO-HDF5 0.73
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            7
</span> license             {Artistic-1 GPL}
 maintainers         nomaintainer
 description         PDL::IO::HDF5 - PDL Interface to the HDF5 Data Format.
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/python/py-h5py/Portfile b/python/py-h5py/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index fa63600..963f97d 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-h5py/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-h5py/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -8,7 +8,7 @@ PortGroup               mpi 1.0
</span> github.setup            h5py h5py 2.10.0
 name                    py-h5py
 # h5py needs to be re-built after hdf5 upgrades
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                1
</span> 
 platforms               darwin
 license                 BSD
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-isce2/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-isce2/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup           active_variants 1.1
</span> PortGroup           compilers 1.0
 
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</span> name                py-isce2
 platforms           darwin
 license             Apache
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-nio/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-nio/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup compilers 1.0
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 name                py-nio
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</span> categories-append   science
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 license             PyNIO
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-pyne/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-pyne/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           python 1.0
</span> 
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</span> name                py-pyne
 categories-append   science
 platforms           darwin
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 0480faa..55101f1 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-stfio/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-stfio/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           python 1.0
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 name                py-stfio
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> categories          python science
 platforms           darwin
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/python/py-tables/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/python/py-tables/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           mpi 1.0
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 name                py-tables
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> categories-append   science
 platforms           darwin
 license             BSD
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -36,7 +36,7 @@ if {${name} ne ${subport}} {
</span>     # Last version that supports python 2.7
     if {${python.version} eq 27} {
         version        3.5.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-        revision       1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        revision       2
</span>         distname       ${python.rootname}-${version}
         checksums      rmd160  9e5aa9f3b270888c853eb5f30cd6461a362bb1c1 \
                        sha256  b220e32262bab320aa41d33125a7851ff898be97c0de30b456247508e2cc33c2 \
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index ace6dc3..498708d 100644
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/ALPSCore/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup           mpi 1.0
</span> PortGroup           cxx11 1.1
 
 github.setup        ALPSCore ALPSCore 2.2.0 v
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            4
</span> 
 categories          science
 platforms           darwin
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/ALPSMaxent/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/ALPSMaxent/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup           github 1.0
</span> name                ALPSMaxent
 
 github.setup        CQMP Maxent 1.0 v
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</span> categories          science
 platforms           darwin
 license             GPL-2
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index b881f8a..abc0646 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/H5Part/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/H5Part/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -4,7 +4,7 @@ PortSystem          1.0
</span> 
 name                H5Part
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            14
</span> categories          science
 maintainers         lbl.gov:ghweber
 license             BSD
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/HDF5-External-Filter-Plugins/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           github 1.0
</span> PortGroup           cmake 1.0
 
 github.setup        nexusformat HDF5-External-Filter-Plugins 0.1.0 v
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span> categories          science
 platforms           darwin
 license             BSD MIT
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 2153307..571aa442 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/alps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/alps/Portfile
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 version                 2.3.0
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</span> categories              science
 platforms               darwin
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/armadillo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup                       mpi 1.0
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</span> categories                      science
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 maintainers                     {mps @Schamschula} openmaintainer
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index babb0ce..7a50dc6 100644
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           linear_algebra 1.0
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 version             2.0.0
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            4
</span> categories          science
 platforms           darwin
 license             BSD
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 3bc0869..1d1966d 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/cdo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/cdo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup                   cxx11 1.1
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</span> platforms                   darwin
 maintainers                 {takeshi @tenomoto} openmaintainer
 license                     GPL-2
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index f1c5da2..1cb4fa4 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/crystfel/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/crystfel/Portfile
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 name                crystfel
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            9
</span> categories          science
 platforms           darwin
 license             GPL-3
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/digital_rf/Portfile b/science/digital_rf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 3318680..36ea26f 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/digital_rf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/digital_rf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           github 1.0
</span> PortGroup           cxx11 1.1
 
 github.setup        MITHaystack digital_rf 2.6.1
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            8
</span> 
 categories          science
 license             BSD
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 570ac63..ec0e92e 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/flann/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/flann/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -4,7 +4,7 @@ PortGroup mpi 1.0
</span> PortGroup github 1.0
 
 github.setup        mariusmuja flann 1.9.1
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            6
</span> categories          science devel
 maintainers         nomaintainer
 description         Fast Library for Approximate Nearest Neighbors
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/gds/Portfile b/science/gds/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 33ad37e..e9b57d6 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/gds/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/gds/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup     python 1.0
</span> 
 name          gds
 version       2.18.7
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision      5
</span> categories    science
 platforms     darwin
 maintainers   {ligo.org:ed.maros @emaros} openmaintainer
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/gmsh/Portfile b/science/gmsh/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index f359b6b..b26790b 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/gmsh/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/gmsh/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -8,7 +8,7 @@ PortGroup               muniversal     1.0
</span> 
 name                    gmsh
 version                 4.5.1
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                0
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</span> categories              science
 platforms               darwin
 license                 GPL-2+
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/gmtk/Portfile b/science/gmtk/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 6889ae1..20f5225 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/gmtk/Portfile
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 name                grads
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 name                h5utils
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/hdf5-lz4-plugin/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -19,7 +19,7 @@ long_description    ${description} Provides very high throughput compression \
</span> set commit          8fa813aa369c15127c551cfdeebe4cbc090b4687
 github.setup        dectris HDF5Plugin ${commit}
 version             20130903
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</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            9
</span> 
 checksums \
     rmd160  03229c8803b5ba198cca61bab8788353d0cc00a2 \
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</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index c61e03c..424ce5c 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/hdf5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/hdf5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,11 +5,11 @@ PortGroup           muniversal 1.0
</span> PortGroup           mpi 1.0
 
 name                hdf5
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-version             1.10.5
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+version             1.10.6
</span> revision            0
 set shortversion    [join [lrange [split ${version} .] 0 1] .]
 categories          science
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-maintainers         nomaintainer
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+maintainers         {eborisch @eborisch} openmaintainer
</span> 
 description         HDF5 general purpose library and file format for storing\
                     scientific data
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -25,9 +25,10 @@ homepage            https://portal.hdfgroup.org/display/HDF5
</span> platforms           darwin
 master_sites \
     https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-${shortversion}/hdf5-${version}/src
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-checksums           rmd160  1880b8688015540abb5d6a73221775d780c07155 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    sha256  68d6ea8843d2a106ec6a7828564c1689c7a85714a35d8efafa2fee20ca366f44 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    size    8706317
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+checksums \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    rmd160  c31216cd83187e69509fa36c6ae7015cee331ea1 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    sha256  09d6301901685201bb272a73e21c98f2bf7e044765107200b01089104a47c3bd \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    size    8813699
</span> mpi.setup           -gcc44 -gcc45
 
 use_bzip2           yes
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -70,12 +71,12 @@ post-configure {
</span>     }
     foreach dir ${dirs} {
         reinplace -E {s|-arch [a-z0-9_]+||g} \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-            ${dir}/tools/src/misc/h5cc \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+            ${dir}/bin/h5cc \
</span>             ${dir}/c++/src/h5c++ \
             ${dir}/src/libhdf5.settings \
             ${dir}/fortran/src/h5fc
         if ${configure.ccache} {
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-            reinplace -W ${dir} {s|ccache ||} tools/src/misc/h5cc c++/src/h5c++
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+            reinplace -W ${dir} {s|ccache ||} bin/h5cc c++/src/h5c++
</span>         }
     }
 }
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/hdf5/files/patch-tools-src-misc-h5cc.in.diff b/science/hdf5/files/patch-tools-src-misc-h5cc.in.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index ba8951c..94fde97 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/hdf5/files/patch-tools-src-misc-h5cc.in.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/hdf5/files/patch-tools-src-misc-h5cc.in.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,5 +1,5 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- tools/src/misc/h5cc.in.orig    2017-04-26 06:45:02.000000000 +0900
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ tools/src/misc/h5cc.in 2017-07-16 09:57:18.000000000 +0900
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+--- bin/h5cc.in.orig       2017-04-26 06:45:02.000000000 +0900
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++++ bin/h5cc.in    2017-07-16 09:57:18.000000000 +0900
</span> @@ -96,9 +96,6 @@
  
  CC="${HDF5_CC:-$CCBASE}"
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/hdfeos5/Portfile b/science/hdfeos5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 9a34afb..7eb6856 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/hdfeos5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/hdfeos5/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup           mpi 1.0
</span> 
 name                hdfeos5
 version             1.16
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span> categories          science
 platforms           darwin
 license             public-domain
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/ismrmrd/Portfile b/science/ismrmrd/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index da31b5f..5102420 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/ismrmrd/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/ismrmrd/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -6,7 +6,7 @@ PortGroup               cmake 1.1
</span> PortGroup               cxx11 1.1
 
 github.setup            ismrmrd ismrmrd v1.4.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                1
</span> categories              science
 maintainers             eborisch openmaintainer
 license                 permissive
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/lal/Portfile b/science/lal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index f710a91..7cd7b2b 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/lal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/lal/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -4,7 +4,7 @@ PortSystem    1.0
</span> 
 name          lal
 version       6.19.1
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision      1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision      2
</span> 
 description   LSC Algorithm Library
 long_description \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -27,13 +27,13 @@ if {[string match "py*" ${subport}]} {
</span>     # python, C-library port, and numpy are automatically added below
     depends_lib     port:py${v}-dateutil port:py${v}-scipy port:py${v}-six \
                     port:py${v}-ligo-segments port:py${v}-lscsoft-glue
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    revision        0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    revision        1
</span> }
 
 # add Octave dependencies for octave subports
 if {[string match "octave-*" ${subport}]} {
     # octave, and C-library port are automatically added below
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    revision        2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    revision        3
</span> }
 
 ###############################################################################
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/magicspp/Portfile b/science/magicspp/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index fcedc67..360ae2a 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/magicspp/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/magicspp/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -12,7 +12,7 @@ perl5.branches      5.28
</span> 
 name                magicspp
 version             4.2.3
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> platforms           darwin
 maintainers         {takeshi @tenomoto}
 license             Apache-2
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/ncarg/Portfile b/science/ncarg/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index aed6219..0ab9b9d 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/ncarg/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/ncarg/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -9,7 +9,7 @@ compilers.setup             require_fortran
</span> 
 name                        ncarg
 version                     6.6.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                    1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                    2
</span> epoch                       1
 set version_no_dot [join [split ${version} "."] ""]
 categories                  science
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/nco/Portfile b/science/nco/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 0b534a9..d7b4ad5 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/nco/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/nco/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           compilers 1.0
</span> PortGroup           github 1.0
 
 github.setup        nco nco 4.9.1
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            1
</span> platforms           darwin
 maintainers         {takeshi @tenomoto}
 license             GPL-3
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/netcdf/Portfile b/science/netcdf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 5992b43..73793ab 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/netcdf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/netcdf/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -7,7 +7,7 @@ PortGroup                   cmake 1.0
</span> PortGroup                   muniversal 1.0
 
 github.setup                Unidata netcdf-c 4.7.3 v
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision                    0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                    1
</span> epoch                       3
 name                        netcdf
 maintainers                 {takeshi @tenomoto} openmaintainer
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/paraview/Portfile b/science/paraview/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 0a29818..a3584bd 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/paraview/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/paraview/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -10,7 +10,7 @@ PortGroup           xcodeversion 1.0
</span> 
 name                paraview
 version             5.6.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            2
</span> 
 categories          science graphics
 platforms           darwin
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/silo/Portfile b/science/silo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 3bc91d3..a8d9133 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/silo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/silo/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,7 @@ PortGroup           compilers 1.0
</span> 
 name                silo
 version             4.10.2
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            8
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            9
</span> categories          science
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 # cannot find license, assume same as ParaView
 license                 BSD
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