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Renee Otten (reneeotten) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/9a1a6c2e17f08326899723b940f9d1077529f030">https://github.com/macports/macports-ports/commit/9a1a6c2e17f08326899723b940f9d1077529f030</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8"><span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit 9a1a6c2e17f08326899723b940f9d1077529f030
</span>Author: Renee Otten <reneeotten@macports.org>
AuthorDate: Sat Jun 20 10:51:29 2020 -0400

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    mafft: use makefile PG
</span>---
 science/mafft/Portfile                  | 12 ++----------
 science/mafft/files/patch-Makefile.diff | 28 ++++++++++++++++++++++++++++
 2 files changed, 30 insertions(+), 10 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/mafft/Portfile b/science/mafft/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 7a95ae0602e..99b72072c2d 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/mafft/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/mafft/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,6 +1,7 @@
</span> # -*- coding: utf-8; mode: tcl; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4 -*- vim:fenc=utf-8:ft=tcl:et:sw=4:ts=4:sts=4
 
 PortSystem          1.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortGroup           makefile 1.0
</span> 
 name                mafft
 version             7.470
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -24,18 +25,9 @@ checksums           rmd160  afd5888d12712def43508ec394deb5d995d6deb3 \
</span> 
 extract.suffix      .tgz
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-post-patch {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    reinplace "s|PREFIX = /usr/local|PREFIX = ${prefix}|g" ${worksrcpath}/core/Makefile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    reinplace "s|DESTDIR =|#DESTDIR =|g" ${worksrcpath}/core/Makefile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    reinplace "s|CC =|#CC =|g" ${worksrcpath}/core/Makefile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-use_configure       no
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+patchfiles-append   patch-Makefile.diff
</span> 
 build.dir           ${worksrcpath}/core
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-build.env           CC=${configure.cc}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-destroot.env        DESTDIR=${destroot}${prefix}
</span> 
 post-destroot {
     set docdir ${prefix}/share/doc/${name}
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/mafft/files/patch-Makefile.diff b/science/mafft/files/patch-Makefile.diff
</span>new file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 00000000000..bee32bd7301
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--- /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/mafft/files/patch-Makefile.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -0,0 +1,28 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+--- core/Makefile.orig     2020-06-20 10:41:54.000000000 -0400
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++++ core/Makefile  2020-06-20 10:50:49.000000000 -0400
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+@@ -1,8 +1,8 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-PREFIX = /usr/local
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-LIBDIR = $(PREFIX)/libexec/mafft
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-BINDIR = $(PREFIX)/bin
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-MANDIR = $(PREFIX)/share/man/man1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-DESTDIR = 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++PREFIX ?= /usr/local
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++LIBDIR ?= $(PREFIX)/libexec/mafft
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++BINDIR ?= $(PREFIX)/bin
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++MANDIR ?= $(PREFIX)/share/man/man1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++DESTDIR ?= 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #MNO_CYGWIN = -mno-cygwin
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+@@ -18,9 +18,9 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ # Uncomment the above line to use protein 3D 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ # structural information.  Go language is required.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-CC = gcc
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++CC ?= gcc
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #CC = icc
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-CFLAGS = -O3
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++#CFLAGS = -O3
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #CFLAGS = -O3 -fPIC
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ # add -fPIC when building .so files
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span></pre><pre style='margin:0'>

</pre>