<pre style='margin:0'>
Ken (kencu) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/caec77d6dadfc3838fbf27279b23fde7e4e05ddf">https://github.com/macports/macports-ports/commit/caec77d6dadfc3838fbf27279b23fde7e4e05ddf</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8">The following commit(s) were added to refs/heads/master by this push:
<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>     new caec77d6dad seqan-apps: replace old seqan-apps port by seqan2-apps
</span>caec77d6dad is described below

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit caec77d6dadfc3838fbf27279b23fde7e4e05ddf
</span>Author: rrahn <rene.rahn@fu-berlin.de>
AuthorDate: Wed Oct 14 00:39:14 2020 +0200

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    seqan-apps: replace old seqan-apps port by seqan2-apps
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    With the current SeqAn version 3 we stopped maintaing all-in-one application packaging.
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    Accordingly, the users cannot expect that there are updates to this package any more.
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    To reflect the end of life-cylce for this port we decided to rename it to the respective seqan version 2.
</span>---
 science/seqan-apps/Portfile                  | 35 +++++++---------------------
 science/{seqan-apps => seqan2-apps}/Portfile |  3 +--
 2 files changed, 10 insertions(+), 28 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/seqan-apps/Portfile b/science/seqan-apps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 2f91564e074..117b290366a 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/seqan-apps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/seqan-apps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,7 +5,9 @@ PortGroup           cmake 1.1
</span> 
 name                seqan-apps
 version             2.4.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            3
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+replaced_by         seqan2-apps
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span> categories          science
 platforms           darwin
 universal_variant   no
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -20,31 +22,12 @@ long_description    SeqAn applications for the analysis of large sets of sequenc
</span> 
 homepage            https://www.seqan.de/applications/
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-depends_lib-append  port:boost \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    port:bzip2 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    port:zlib
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-depends_run-append  port:coinor-liblemon
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-master_sites        http://packages.seqan.de/seqan-src
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-distfiles           seqan-src-${version}${extract.suffix}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-distname            seqan-seqan-v${version}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-checksums           rmd160  c843f8c749e6f2d8ff5233f160d9683743dce7c2 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    sha256  d7084d17729214003e84818e0280a16f223c8f1c6a30eeef040c27e0c0047bd7 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    size    109626901
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-compiler.cxx_standard   2014
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-compiler.openmp_version 3.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-configure.args-append   -DSEQAN_BUILD_SYSTEM=SEQAN_RELEASE_APPS
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+livecheck.type      none
</span> 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-if {${os.platform} eq "darwin" && ${os.major} < 16} {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    known_fail yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    pre-fetch {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-        ui_error "${name} ${version} requires macOS 10.12 or greater."
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-        return -code error "Incompatible macOS version."
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    }
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+pre-configure {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    ui_error "Please do not install this port since it has been replaced by 'seqan2-apps'.\
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+              Note that the all-in-one application package is not supported any more in seqan3."
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    return -code error
</span> }
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-livecheck.url       http://packages.seqan.de/
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-livecheck.regex     seqan-src-(\[0-9.\]+)${extract.suffix}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+distfiles
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/seqan-apps/Portfile b/science/seqan2-apps/Portfile
</span>similarity index 96%
copy from science/seqan-apps/Portfile
copy to science/seqan2-apps/Portfile
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 2f91564e074..299c9b80c4f 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/seqan-apps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/seqan2-apps/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -3,9 +3,8 @@
</span> PortSystem          1.0
 PortGroup           cmake 1.1
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-name                seqan-apps
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+name                seqan2-apps
</span> version             2.4.0
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision            2
</span> categories          science
 platforms           darwin
 universal_variant   no
</pre><pre style='margin:0'>

</pre>