<pre style='margin:0'>
Christopher Nielsen (mascguy) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/e0708bae970531af0e5168565a85fd41954044ef">https://github.com/macports/macports-ports/commit/e0708bae970531af0e5168565a85fd41954044ef</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8">The following commit(s) were added to refs/heads/master by this push:
<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>     new e0708bae970 ncbi_tools: move data to ${prefix}/share * Fix mtree violation, as data was being installed to ${prefix}/data
</span>e0708bae970 is described below

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit e0708bae970531af0e5168565a85fd41954044ef
</span>Author: Christopher Nielsen <mascguy@github.com>
AuthorDate: Sat May 29 11:54:14 2021 -0400

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    ncbi_tools: move data to ${prefix}/share
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * Fix mtree violation, as data was being installed to ${prefix}/data
</span>---
 science/ncbi_tools/Portfile | 32 +++++++++++++++++++++++---------
 1 file changed, 23 insertions(+), 9 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/ncbi_tools/Portfile b/science/ncbi_tools/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 0741597574c..34f9d181bd3 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/ncbi_tools/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/ncbi_tools/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -9,7 +9,7 @@ license         public-domain
</span> maintainers     nomaintainer
 
 version         20120620
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-revision        0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision        1
</span> 
 description     Blast is a set of tools for doing nucleotide and protein searches
 long_description \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -38,10 +38,10 @@ depends_build-append \
</span> build.cmd       ${prefix}/bin/tcsh
 build.target
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-# Need to clear all build args, include pre and post, as we aren't using Make
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# Need to clear build args, pre and post, as we aren't using Make
</span> build.pre_args
 build.post_args
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-build.args      -c ./ncbi/make/makedis.csh
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+build.args      -f -c ./ncbi/make/makedis.csh
</span> 
 set binaries    \
 [list \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -56,7 +56,7 @@ set binaries    \
</span>     bl2seq           formatrpsdb      nph-viewgif.cgi  taxblast \
     debruijn         gene2xml         vecscreen \
     demo_regexp      getmesh          wblast2.REAL \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    demo_regexp_grep getpub           rpsblast         wblast2_cs.REAL\
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    demo_regexp_grep getpub           rpsblast         wblast2_cs.REAL \
</span> ]
 
 set manpages    \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -101,21 +101,35 @@ set datafiles   \
</span>     KSchoth.flt                        SSURef_93.fasta.nsq \
 ]
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+set ncbi_dir_doc \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    ${prefix}/share/doc/${name}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+set ncbi_dir_man \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    ${prefix}/share/man/man1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+set ncbi_dir_data \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    ${prefix}/share/${name}/data
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span> destroot {
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    xinstall -m 755 -d  ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    file copy ${worksrcpath}/ncbi/doc ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    xinstall -m 755 -d ${destroot}${ncbi_dir_doc}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    file copy ${worksrcpath}/ncbi/doc ${destroot}${ncbi_dir_doc}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span>     foreach binary ${binaries} {
         xinstall -m 755 ${worksrcpath}/ncbi/bin/${binary} ${destroot}${prefix}/bin/
     }
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span>     foreach manpage ${manpages} {
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/doc/man/${manpage} ${destroot}${prefix}/share/man/man1/
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/doc/man/${manpage} ${destroot}${ncbi_dir_man}/
</span>     }
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-    xinstall -m 755 -d  ${destroot}${prefix}/data
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    xinstall -m 755 -d ${destroot}${ncbi_dir_data}
</span>     foreach datafile ${datafiles} {
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/data/${datafile} ${destroot}${prefix}/data/
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        xinstall -m 444 ${worksrcpath}/ncbi/data/${datafile} ${destroot}${ncbi_dir_data}/
</span>     }
 }
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+notes "
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+  Data files have moved from ${prefix}/data to ${ncbi_dir_data}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span> livecheck.type      regex
 livecheck.url       ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/
 livecheck.regex     old/(\[0-9\]+)
</pre><pre style='margin:0'>

</pre>