<pre style='margin:0'>
David B. Evans (dbevans) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/5b87897bab93ce7b77496e7142360bacb551efb8">https://github.com/macports/macports-ports/commit/5b87897bab93ce7b77496e7142360bacb551efb8</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8">The following commit(s) were added to refs/heads/master by this push:
<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>     new 5b87897bab9 p5-ipe: fix build and livecheck, rebuild
</span>5b87897bab9 is described below

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit 5b87897bab93ce7b77496e7142360bacb551efb8
</span>Author: David B. Evans <devans@macports.org>
AuthorDate: Wed Aug 3 15:51:01 2022 -0700

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    p5-ipe: fix build and livecheck, rebuild
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * apply patch to fix implicit function declaration
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * update homepage, master_sites, descriptions, livecheck
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * explicitly state revision
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    * add size to checksums
</span>---
 perl/p5-ipe/Portfile                               | 22 +++++++++++++++-------
 .../files/fix-implicit-function-declaration.patch  | 10 ++++++++++
 2 files changed, 25 insertions(+), 7 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/perl/p5-ipe/Portfile b/perl/p5-ipe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index e75b46e2e02..8242f0539c2 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/perl/p5-ipe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/perl/p5-ipe/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,29 +5,37 @@ PortGroup           perl5 1.0
</span> 
 perl5.branches      5.28 5.30 5.32 5.34
 perl5.setup         iPE 0.3.1
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            1
</span> distname            ipe-${perl5.moduleversion}
 categories          perl biology
 license             BSD
 maintainers         cse.wustl.edu:rpz
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-description         Perl module for parameter estimation with hidden Markov models.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-long_description    iPE is parameter estimation software for generalized hidden Markov models. \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    For information and documentation, see http://mblab.wustl.edu
</span> 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-homepage            http://mblab.wustl.edu
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-master_sites        http://mblab.wustl.edu/software/download/
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+homepage            https://mblab.wustl.edu/software.html
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+master_sites        https://mblab.wustl.edu/software/download/
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+description         Perl module for parameter estimation for Hidden Markov Models.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+long_description    iParameterEstimation is a highly configurable maximum likelihood \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    parameter estimation package for generalized Hidden Markov Models. \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    Specific configuration files are included for training Twinscan, \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    N-SCAN and their EST variants. \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    For information and documentation, see ${homepage}.
</span> 
 platforms           darwin
 
 checksums           rmd160  57df46c0d1e25c242500bbcb070aa02aaed0f714 \
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    sha256  9849fbbd64d51b72d22a40dff292079949ac7f5d519cf88248b2c58f047c4448
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    sha256  9849fbbd64d51b72d22a40dff292079949ac7f5d519cf88248b2c58f047c4448 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    size    22657646
</span> 
 if {${perl5.major} != ""} {
     depends_lib-append \
                     port:p${perl5.major}-eval \
                     port:p${perl5.major}-libxml-enno \
                     port:p${perl5.major}-xml-libxml
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    patchfiles      fix-implicit-function-declaration.patch
</span> }
 
 livecheck.type      regex
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-livecheck.url       ${master_sites}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+livecheck.url       ${homepage}
</span> livecheck.regex     "ipe-(\\d+(?:\\.\\d+)*)${extract.suffix}"
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/perl/p5-ipe/files/fix-implicit-function-declaration.patch b/perl/p5-ipe/files/fix-implicit-function-declaration.patch
</span>new file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 00000000000..78f46b873ec
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--- /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/perl/p5-ipe/files/fix-implicit-function-declaration.patch
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -0,0 +1,10 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+--- iPE.xs.orig    2022-08-03 15:24:21.000000000 -0700
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++++ iPE.xs 2022-08-03 15:24:47.000000000 -0700
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+@@ -2,6 +2,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #include "perl.h" 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #include "XSUB.h" 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ #include "bntree.h"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++#include "training.h"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ MODULE = iPE PACKAGE = iPE
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span></pre><pre style='margin:0'>

</pre>