<pre style='margin:0'>
Herby Gillot (herbygillot) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/19721c0972142b7c36bc09e889bac9ec0598573e">https://github.com/macports/macports-ports/commit/19721c0972142b7c36bc09e889bac9ec0598573e</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8"><span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit 19721c0972142b7c36bc09e889bac9ec0598573e
</span>Author: Sergey Fedorov <vital.had@gmail.com>
AuthorDate: Fri Jun 30 07:34:18 2023 +0800

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    R-neojags: new port
</span>---
 R/R-neojags/Portfile                      | 47 +++++++++++++++++++++++++++++++
 R/R-neojags/files/patch-fix-Makevars.diff | 23 +++++++++++++++
 2 files changed, 70 insertions(+)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/R/R-neojags/Portfile b/R/R-neojags/Portfile
</span>new file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 00000000000..b20caea62d4
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--- /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/R/R-neojags/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -0,0 +1,47 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# -*- coding: utf-8; mode: tcl; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4 -*- vim:fenc=utf-8:ft=tcl:et:sw=4:ts=4:sts=4
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortSystem          1.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortGroup           R 1.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+R.setup             cran madsyair neojags 0.1.1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision            0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+categories-append   math
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+maintainers         {@barracuda156 gmail.com:vital.had} openmaintainer
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+license             GPL-2
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+description         Neo-normal distributions family for Markov Chain Monte Carlo (MCMC) models in JAGS
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+long_description    {*}${description}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+checksums           rmd160  e4140c411a8be15ff8a36754da5765ffd36ca414 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    sha256  7201f04acebcb37364b9d90d828ec082c7d8bd093e40498c4f0ac0a4ced33bab \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    size    414245
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# Retaining this in case configure is fixed by upstream, see below.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# depends_build-append \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:pkgconfig
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+depends_lib-append  port:jags \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-coda \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-rjags \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-runjags
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# configure script has been designed to sabotage the build, and it does so neatly.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# https://github.com/madsyair/neojags/issues/1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# Guess what,
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+post-extract {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    delete ${worksrcpath}/configure
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    move ${worksrcpath}/src/Makevars.in ${worksrcpath}/src/Makevars
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# Instead, set everything needed in Makevars.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# Notice, JAGS 4.x is assumed.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+patchfiles          patch-fix-Makevars.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+post-patch {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    reinplace "s|@PREFIX@|${prefix}|g" ${worksrcpath}/src/Makevars
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+depends_test-append port:R-knitr \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-markdown \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-rmarkdown \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-spelling \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    port:R-testthat
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+test.run            yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/R/R-neojags/files/patch-fix-Makevars.diff b/R/R-neojags/files/patch-fix-Makevars.diff
</span>new file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 00000000000..821d2f67bdb
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--- /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/R/R-neojags/files/patch-fix-Makevars.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -0,0 +1,23 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+--- src/Makevars   2023-06-22 08:04:14.000000000 +0800
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++++ src/Makevars   2023-06-30 06:50:31.000000000 +0800
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+@@ -16,8 +16,8 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ ###  JAGS_MAJOR_ASSUMED is not needed (always 0) on unix
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ ###############
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-PKG_CPPFLAGS=@JAGS_CFLAGS@ -D JAGS_MAJOR_FORCED=0$(JAGS_MAJOR_VERSION) -D JAGS_MAJOR_ASSUMED=0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-PKG_LIBS=@JAGS_LIBS@ -ljrmath @JAGS_RPATH@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++PKG_CPPFLAGS= -I@PREFIX@/include/JAGS -D JAGS_MAJOR_FORCED=4 -D JAGS_MAJOR_ASSUMED=0 -D _GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++PKG_LIBS= -L@PREFIX@/lib -ljags -ljrmath
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ ###############
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+--- cleanup        2023-06-28 08:26:10.000000000 +0800
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>++++ cleanup        2023-06-30 07:08:35.000000000 +0800
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+@@ -18,7 +18,6 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ rm -rf src/functions/.deps
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ rm -rf src/functions/.libs
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+-rm -f src/Makevars
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ rm -f config.*
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ rm -rf autom4te.cache
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+ rm -f config.log
</span></pre><pre style='margin:0'>

</pre>