<pre style='margin:0'>
Perry E. Metzger (pmetzger) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/fd9d2bf0965cd2074315a825d50353fa88deaedb">https://github.com/macports/macports-ports/commit/fd9d2bf0965cd2074315a825d50353fa88deaedb</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8"><span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit fd9d2bf0965cd2074315a825d50353fa88deaedb
</span>Author: jpenguen <julien.penguen@u-bordeaux.fr>
AuthorDate: Wed Jan 17 08:52:08 2024 +0100

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    anothers corrections for update to v3.9-11
</span>---
 science/imager/Portfile                            | 23 +++------
 .../imager/files/patch-admin-Makefile.build.diff   | 20 --------
 science/imager/files/patch-admin-Makefile.def.diff | 39 --------------
 .../imager/files/patch-admin-Makefile.python.diff  | 23 ---------
 .../imager/files/patch-admin-define-system.sh.diff | 59 ----------------------
 .../imager/files/patch-admin-imager-env.sh.diff    | 57 ---------------------
 6 files changed, 8 insertions(+), 213 deletions(-)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/Portfile b/science/imager/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index a70b4b768d6..e0dc50fcd8f 100644
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/imager/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -5,14 +5,14 @@ PortGroup           active_variants 1.1
</span> PortGroup           compilers 1.0
 
 name                imager
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-version             202310
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-set source_version  3.9-05
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+version             202401
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+set source_version  3.9-11
</span> set my_version      [string tolower [clock format [clock scan 2000-[string range ${version} 4 5]-10] -format %b]][string range ${version} 2 3][string range ${version} 6 end]
 
 supported_archs     arm64 x86_64
 set my_machine      [if {[string match *arm* ${os.arch}]} {list arm64} {list x86_64}]
 categories          science
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-maintainers         {u-bordeaux.fr:julien.penguen @penguen}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+maintainers         {u-bordeaux.fr:julien.penguen @PenguenJulien}
</span> license             permissive
 
 description         Radio-interferometry data analysis software
<span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -24,22 +24,15 @@ homepage            https://imager.oasu.u-bordeaux.fr
</span> 
 set site_base       https://nuage.oasu.u-bordeaux.fr/index.php/s/PoxdxMTTYXqNwKF
 master_sites        ${site_base}/download?path=/&files=
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-distname            ${name}-${my_version}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+distname            patched-macport-${name}-${my_version}
</span> 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-checksums           rmd160  0279d3cea7d966433eeda9909d2abc26db483eb3 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    sha256  4e29dd0d740e6549934116a0bd34834950fe3179fb3652e30ea888ac049fc67c \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    size    32453347
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+checksums           rmd160  7b36e6706c3b46f05ca2b93c2eab2b89b5699736 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    sha256  b63123fe82093d3c76778014f2c2310a17e8eefa78b5d8b9440611e3a9e9aadf \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                    size    32483166
</span> 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-set py_ver          3.11
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+set py_ver          3.12
</span> set py_ver_nodot    [string map {. {}} ${py_ver}]
 
<span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-patch.pre_args      -p1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-patchfiles          patch-admin-Makefile.def.diff \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    patch-admin-Makefile.python.diff \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    patch-admin-Makefile.build.diff \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    patch-admin-imager-env.sh.diff \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                    patch-admin-define-system.sh.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-
</span> # coreutils needed to use GNU gsort instead of native BSD sort as older version
 # of sort do not support sort -V:
 depends_build-append \
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.build.diff b/science/imager/files/patch-admin-Makefile.build.diff
</span>deleted file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 029116eb4f7..00000000000
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.build.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,20 +0,0 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- alma_imager/admin/Makefile.build.orig  2020-03-02 11:18:21.000000000 +0100
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ alma_imager/admin/Makefile.build       2020-03-02 11:19:09.000000000 +0100
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -304,7 +304,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # if umask is 0022).
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- PYRECIPE = \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-   if [ "$(PYTHON3_PRESENT)" = "yes" ]; then \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--          python -c "import lib2to3.main; lib2to3.main.main('lib2to3.fixes',args=['$<'])" > $<.patch; \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+          @PYTHON@ -c "import lib2to3.main; lib2to3.main.main('lib2to3.fixes',args=['$<'])" > $<.patch; \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           if test -s $<.patch; then \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   touch $@; \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   patch -i $<.patch -o $@; \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -317,7 +317,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-   fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- PYCOMPILE = \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--  python -c "import py_compile; py_compile.compile('$@')"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+  @PYTHON@ -c "import py_compile; py_compile.compile('$@')"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- $(bindir)/%.py: %.py | $(bindir)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-   $(PYRECIPE)
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.def.diff b/science/imager/files/patch-admin-Makefile.def.diff
</span>deleted file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index fcde781c62e..00000000000
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.def.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,39 +0,0 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- alma_imager/admin/Makefile.def.orig    2015-11-30 13:25:52.000000000 +0100
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ alma_imager/admin/Makefile.def 2015-12-04 16:19:05.000000000 +0100
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -72,12 +72,12 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # The following variables are provided to the user so that he can override
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # the preprocessing, compilation and linking options defined by default
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # later in this file. User can modify them here.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--CPPFLAGS = $(GAG_CPPFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--SLDFLAGS = $(GAG_SLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--FLDFLAGS = $(GAG_FLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--CLDFLAGS = $(GAG_CLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--FFLAGS = $(GAG_FFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--CFLAGS = $(GAG_CFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+CPPFLAGS = @CPPFLAGS@ $(GAG_CPPFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+SLDFLAGS = @LDFLAGS@ $(GAG_SLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+FLDFLAGS = @LDFLAGS@ $(GAG_FLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+CLDFLAGS = @LDFLAGS@ $(GAG_CLDFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+FFLAGS = @FCFLAGS@ $(GAG_FFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+CFLAGS = @CCFLAGS@ $(GAG_CFLAGS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # The following variables are for mandatory GLOBAL definitions.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # They should be modified only in this file.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -219,7 +219,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # Fortran preprocessing
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # Preprocessor command
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--CPP = cpp
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+CPP = @CPP@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # Preprocessor generic flags
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- GLOBAL_CPPFLAGS += -P -traditional -C 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -551,7 +551,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- SIC_SYS_LIBS =
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- SIC_LIB_DEPENDS += $(_GAG_LIBS) $(LEGACY_LIBS)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- ifeq ($(PYTHON_PRESENT),yes)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--  SIC_SYS_LIBS += $(shell python $(gagadmdir)/python-config-ldflags.py)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+  SIC_SYS_LIBS += $(shell @PYTHON@ $(gagadmdir)/python-config-ldflags.py)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- endif
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- ifeq ($(CFITSIO_PRESENT),yes)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-   SIC_LIB_DEPENDS += -lcfitsio
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.python.diff b/science/imager/files/patch-admin-Makefile.python.diff
</span>deleted file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 28dcffd8939..00000000000
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/files/patch-admin-Makefile.python.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,23 +0,0 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- alma_imager/admin/Makefile.python.orig 2023-09-05 09:31:48
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ alma_imager/admin/Makefile.python      2023-09-07 09:40:11
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -21,9 +21,9 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # PYTHON_SO_EXT=$(shell python -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('SO'))")
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- # Starting from 3.11, SO is indeed no longer working, and returns *None
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- ifeq ($(PYTHON3_PRESENT),yes)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--  PYTHON_SO_EXT=$(shell python -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('EXT_SUFFIX'))")
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+  PYTHON_SO_EXT=$(shell @PYTHON@ -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('EXT_SUFFIX'))")
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- else
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--  PYTHON_SO_EXT=$(shell python -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('SO'))")
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+  PYTHON_SO_EXT=$(shell @PYTHON@ -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('SO'))")
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- endif
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- MOD_NAME = $(pythondir)/$(MOD_IDENTITY)$(PYTHON_SO_EXT)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -55,7 +55,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- ifneq ($(MOD_IDENTITY),)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- $(MOD_NAME): $(MOD_SOURCES) $(MOD_INCLUDES) $(MOD_EXTRAS) $(builddir)/setup.py $(SO_NAME) | $(pythondir)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--  $(GAG_PYTHON_DISTFLAGS) python $(builddir)/setup.py build --build-base $(builddir) --build-lib $(builddir)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+  $(GAG_PYTHON_DISTFLAGS) @PYTHON@ $(builddir)/setup.py build --build-base $(builddir) --build-lib $(builddir)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-   $(MV) $(builddir)/*$(PYTHON_SO_EXT) $(pythondir)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- 
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>- ifeq ($(gagusedir),)
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/files/patch-admin-define-system.sh.diff b/science/imager/files/patch-admin-define-system.sh.diff
</span>deleted file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index a94949ab671..00000000000
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/files/patch-admin-define-system.sh.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,59 +0,0 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- alma_imager/admin/define-system.sh.orig        2020-06-02 16:38:16.000000000 +0200
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ alma_imager/admin/define-system.sh     2020-06-16 16:56:39.000000000 +0200
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -25,7 +25,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         # Return 0 if first argument is "lower or equal" the second argument
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         # NB: the line return in echo below is more portable than echo -e "\n"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         [  "$1" = "`echo "$1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--$2" | sort -V | head -n1`" ]
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+$2" | @PREFIX@/bin/gsort -V | head -n1`" ]
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     }
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     verlt() {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         # Return 0 if first argument is "lower than" second argument
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -236,18 +236,18 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           else
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               GAG_MACHINE=pc
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--                if which gcc > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--                    DEFAULT_CCOMPILER=gcc
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+                if which @CC@ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+                    DEFAULT_CCOMPILER=@CC@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                 fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--                if which g++ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--                    DEFAULT_CXXCOMPILER=g++
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+                if which @CXX@ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+                    DEFAULT_CXXCOMPILER=@CXX@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                 elif which clang++ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                     DEFAULT_CXXCOMPILER=clang++
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                 fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           if which ifort > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               DEFAULT_FCOMPILER=ifort
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--          elif which gfortran > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              DEFAULT_FCOMPILER=gfortran
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+          elif which @FC@ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              DEFAULT_FCOMPILER=@FC@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-             fi ;;
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         CYGWIN*)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -446,10 +446,12 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-             GAG_COMPILER_FLIBS="-lgfortran"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         #
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--        CPP_VERSION=`cpp --version | head -1 | \sed "s%.*[^0-9]\([0-9][0-9]*\.[0-9][0-9]*\.[0-9][0-9]*\).*%\1%"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+        CPP_VERSION=`@CPP@ --version | head -1 | \sed "s%.*[^0-9]\([0-9][0-9]*\.[0-9][0-9]*\.[0-9][0-9]*\).*%\1%"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         if verle "4.8" "$CPP_VERSION"; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-             # See http://gcc.gnu.org/gcc-4.8/porting_to.html
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-             GAG_COMPILER_CPPFLAGS="$GAG_COMPILER_CPPFLAGS -ffreestanding"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+        elif [ "$CPP_VERSION" != "${CPP_VERSION/clang/}" ]; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+            GAG_COMPILER_CPPFLAGS="$GAG_COMPILER_CPPFLAGS -ffreestanding"
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         #
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-         export GAG_COMPILER_FFLAGS GAG_COMPILER_FLIBS GAG_COMPILER_CPPFLAGS
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -472,7 +474,7 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     #  source admin/gildas-env.sh -c ifort  (use default ifort e.g. ifort 11) and
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     #  source admin/gildas-env.sh -c ifort14  (i.e. use namely non default ifort 14)
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     # does not build their binaries in the same integration branch.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--    GAG_EXEC_SYSTEM=$GAG_MACHINE-$GAG_TARGET_VERS-$GAG_COMPILER_FEXE$GAG_CONFIG
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+    GAG_EXEC_SYSTEM=$GAG_MACHINE-$GAG_TARGET_VERS-$GAG_COMPILER_FKIND
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     export GAG_COMP_SYSTEM GAG_EXEC_SYSTEM
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     export GAG_MACHINE GAG_CONFIG
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     export GAG_ENV_KIND GAG_ENV_VERS
</span><span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/imager/files/patch-admin-imager-env.sh.diff b/science/imager/files/patch-admin-imager-env.sh.diff
</span>deleted file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index b9cdaf4067e..00000000000
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>--- a/science/imager/files/patch-admin-imager-env.sh.diff
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -1,57 +0,0 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>---- alma_imager/admin/imager-env.sh.orig   2023-04-26 12:12:13
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+++ alma_imager/admin/imager-env.sh        2023-09-07 09:34:18
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -401,24 +401,24 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-       NUMPY_PRESENT=no
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-       SQLITE3_PRESENT=no
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-       SETUPTOOLS_PRESENT=no
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--      if \which python > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+      if \which @PYTHON@ > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           # Check the version of python the user is currently using
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--          if python -V 2>&1 > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              PYTHON_VERS_FULL=`python -V 2>&1 | cut -d' ' -f2`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+          if @PYTHON@ -V 2>&1 > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              PYTHON_VERS_FULL=`@PYTHON@ -V 2>&1 | cut -d' ' -f2`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               PYTHON_VERS=`echo $PYTHON_VERS_FULL | \sed "s%\([0-9]\.[0-9][0-9]*\).*%\1%"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               # Search for Python header and library. kernel/python/binding/setup.py
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               # does exactly the same, so this should be consistent
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              PYTHON_INC_DIR=`python -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('INCLUDEPY'))"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              PYTHON_INC_DIR=`@PYTHON@ -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('INCLUDEPY'))"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               if [ -e "$PYTHON_INC_DIR/Python.h" ]; then PYTHON_INC=yes; else PYTHON_INC=no; fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              PYTHON_LIB_DIR=`python -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('LIBDIR'))"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              PYTHON_LIB_DIR=`@PYTHON@ -c "import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('LIBDIR'))"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               PYTHON_LIB=yes  # libpython name on the various supported systems is just
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                               # unpredictible. Can not check in advance if the linker will
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                               # find it or not. See also our script python-config-ldflags.py
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               #
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               # Now search for Numpy
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              if python -c "import numpy" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              if @PYTHON@ -c "import numpy" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   NUMPY_PRESENT=yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--                  NUMPY_INC_DIR=`python -c "import numpy; print(numpy.__path__[0] + '/core/include')"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+                  NUMPY_INC_DIR=`@PYTHON@ -c "import numpy; print(numpy.__path__[0] + '/core/include')"`
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   if [ -e "$NUMPY_INC_DIR/numpy/arrayobject.h" ]; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                       NUMPY_INC_PRESENT=yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   else
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -426,11 +426,11 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               # Search for sqlite3
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              if python -c "import sqlite3" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              if @PYTHON@ -c "import sqlite3" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   SQLITE3_PRESENT=yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               # Search for setuptools
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--              if python -c "import setuptools" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+              if @PYTHON@ -c "import setuptools" > /dev/null 2>&1; then
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-                   SETUPTOOLS_PRESENT=yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-               fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-           fi
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-@@ -736,6 +736,8 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     # environment variables:
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     #
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     unset GAG_LIB_DEP_PATH GAG_INC_DEP_PATH  # Incremented by detection functions
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+    GAG_INC_DEP_PATH=@PREFIX@/include
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-+    GAG_LIB_DEP_PATH=@PREFIX@/lib
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     #
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     gagenv_detect_atm
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>-     gagenv_message ""
</span></pre><pre style='margin:0'>

</pre>