<pre style='margin:0'>
Renee Otten (reneeotten) pushed a commit to branch master
in repository macports-ports.

</pre>
<p><a href="https://github.com/macports/macports-ports/commit/e9515bd5a35ebe173c7b31504de9c25c9d51d327">https://github.com/macports/macports-ports/commit/e9515bd5a35ebe173c7b31504de9c25c9d51d327</a></p>
<pre style="white-space: pre; background: #F8F8F8"><span style='display:block; white-space:pre;color:#808000;'>commit e9515bd5a35ebe173c7b31504de9c25c9d51d327
</span>Author: jwhowarth <howarth.mailing.lists@gmail.com>
AuthorDate: Thu Jun 6 11:24:53 2024 -0400

<span style='display:block; white-space:pre;color:#404040;'>    propka: new port, version 3.5.1
</span>---
 science/propka/Portfile | 45 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
 1 file changed, 45 insertions(+)

<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>diff --git a/science/propka/Portfile b/science/propka/Portfile
</span>new file mode 100644
<span style='display:block; white-space:pre;color:#808080;'>index 00000000000..dbc28a0e93b
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#ffe0e0;'>--- /dev/null
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0ff;'>+++ b/science/propka/Portfile
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0e0e0;'>@@ -0,0 +1,45 @@
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# -*- coding: utf-8; mode: tcl; tab-width: 4; indent-tabs-mode: nil; c-basic-offset: 4 -*- vim:fenc=utf-8:ft=tcl:et:sw=4:ts=4:sts=4
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortSystem              1.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortGroup               python 1.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+PortGroup               github 1.0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+github.setup            jensengroup propka 3.5.1 v
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+github.tarball_from     tarball
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+revision                0
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+categories              science python
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+supported_archs         noarch
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+platforms               {darwin any}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+license                 LGPL-2.1
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+maintainers             {gmail.com:howarth.at.macports @jwhowarth} openmaintainer
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+description             Heuristic pKa calculations with ligands
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+long_description        {*}${description}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+checksums               rmd160  c4654d7cff915449bc4bb33c90357da9f2e5f025 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                        sha256  9f25ba5e57ecbc138692a87dd73c777af53acb544606a9d6a34478997abb0b18 \
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+                        size    376314
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+python.default_version  312
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+depends_test-append     port:py${python.version}-numpy
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+test.run                yes
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+post-destroot {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    ln -fs ${python.prefix}/bin/propka3 ${destroot}/${prefix}/bin/propka
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+}
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+# remove after June 17, 2025
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+pre-activate {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    # pdb2pqr previously provided a c-based version of propka binary
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    # which now is provided from its own python-based package.
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    if {![catch {lindex [registry_active pdb2pqr] 0} installed]} {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        set _version [lindex $installed 1]
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        if {[vercmp $_version 3.6.1] < 0} {
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+            # pdb2pqr used to install propka executable  now provided by propka
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+            registry_deactivate_composite pdb2pqr "" [list ports_nodepcheck 1]
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+        }
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+    }
</span><span style='display:block; white-space:pre;background:#e0ffe0;'>+}
</span></pre><pre style='margin:0'>

</pre>