<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
I should add the full process from the start of the upgrade execise:
<div class=""><br class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">sudo port upgrade outdated</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Computing dependencies for gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Fetching archive for gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Attempting to fetch gdbm-1.16_0.darwin_17.x86_64.tbz2 from
<a href="http://nou.nc.packages.macports.org/pub/macports/packages.macports.org/gdbm" class="">
http://nou.nc.packages.macports.org/pub/macports/packages.macports.org/gdbm</a></span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Attempting to fetch gdbm-1.16_0.darwin_17.x86_64.tbz2.rmd160 from
<a href="http://nou.nc.packages.macports.org/pub/macports/packages.macports.org/gdbm" class="">
http://nou.nc.packages.macports.org/pub/macports/packages.macports.org/gdbm</a></span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Installing gdbm @1.16_0</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Cleaning gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Computing dependencies for gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Deactivating gdbm @1.15_0</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Cleaning gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Activating gdbm @1.16_0</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Cleaning gdbm</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">--->  Computing dependencies for protobuf3-cpp</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">Error: Can't install protobuf3-cpp because conflicting ports are active: protobuf-cpp</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">Error: Problem while installing protobuf3-cpp</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">Error: Follow <a href="https://guide.macports.org/#project.tickets" class="">
https://guide.macports.org/#project.tickets</a> to report a bug.</span></div>
<div style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);" class="">
<span style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures" class="">MBP4:~ dcn</span></div>
<div><br class="">
</div>
<div>DN</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 22 Jul 2018, at 2:12 pm, David Nicholls <<a href="mailto:david.nicholls@anu.edu.au" class="">david.nicholls@anu.edu.au</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">This occurred just now:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="" style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);">
<span class="" style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">sudo port upgrade outdated</span></div>
<div class="" style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);">
<span class="" style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">--->  Computing dependencies for protobuf3-cpp</span></div>
<div class="" style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);">
<span class="" style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">Error: Can't install protobuf3-cpp because conflicting ports are active: protobuf-cpp</span></div>
<div class="" style="margin: 0px; font-stretch: normal; font-size: 13px; line-height: normal; font-family: Monaco; color: rgb(244, 244, 244); background-color: rgba(0, 0, 0, 0.85098);">
<span class="" style="font-variant-ligatures: no-common-ligatures;">Error: Problem while installing protobuf3-</span></div>
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">This is listed in several Ticket discussions from earlier this year but it's not obvious to me what to do to fix it </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Advice appreciated.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">DN</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>